Tuvo como participantes a doce equipos profesionales.

A los 8 equipos que conservaron la categoría en la temporada anterior, se les unieron el descendido Universidad Cesar Vallejo; Alfonso Ugarte y Deportivo Curibamba (quienes compraron las categorías de Atlético Universidad -también descendido- y Sporting Cristal B respectivamente), además de los clubes Atlético Minero y UTC, quienes obtuvieron el derecho a participar mediante un concurso público.

De esta forma, el torneo se convirtió en una verdadera Segunda División Nacional.

Al final de las 22 fechas, Deportivo Municipal se consagró campeón y obtuvo el ascenso a la Primera División.

Por otro lado, Villa del Mar y Deportivo Curibamba descendieron y fueron relegados a la Etapa Regional de la Copa Perú 2007.