Alianza Lima se coronó campeón del Apertura, mientras que Cienciano hizo lo propio en el Clausura.
Los dos peores equipos de la temporada, Unión Huaral y José Gálvez, descendieron a la Segunda División.
El equipo rosado ganó por penales, mandando al conjunto chimbotano a la Segunda División.
El encuentro lo ganó el equipo cusqueño, que de esta forma obtuvo un cupo para la Copa Libertadores 2007 y el derecho a enfrentar al campeón del Apertura por el Título Nacional.
José Herrera Jair Céspedes Julio Landauri Juan Quiñónez Gianfranco Labarthe Milton Marquillo Sergio Ibarra Cristian Ortiz Víctor Reyes Sebastián Domínguez Alexander Sánchez Armando Gonzales