Debido a esto, se creó el Ministerio de Administración Territorial en 1979 y que desapareció en 1986.

La primera se centraba en las relaciones con las autonomías y el desarrollo del Estado autonómico mientras que la segunda a penas duró unos meses y se encargaba de las entidades locales.

Tras la supresión de la segunda, las direcciones generales sobre administración local dependieron directamente del ministro.

En 1987 se creó el Ministerio de Administraciones Públicas que asumía funciones sobre la función pública y la organización territorial, creando la Secretaría de Estado para las Administraciones Territoriales que se centraba en las relaciones con las diferentes administraciones, tanto autonómicas como locales.

De acuerdo con los Presupuestos Generales del Estado para 2023, la SEPT participa en tres programas: