[4]​[5]​ En los años siguientes ocupó distintas secretarías de Estado con José María Aznar y giró hacia posiciones más hostiles con el nacionalismo catalán.

[8]​[9]​En 2016 se hizo público un escándalo por el que Fernández Díaz habría conspirado para fabricar casos de corrupción contra partidos independentistas, lo que motivó su no renovación al frente del Ministerio, siendo sustituido por Juan Ignacio Zoido.

[12]​ En 2017 el Congreso de los Diputados consideró probada la creación de una «policía política» durante su mandato, liderada por Eugenio Pino con consentimiento del ministro, que investigó extrajudicialmente a adversarios políticos.

[15]​ Fernández Díaz es miembro supernumerario del Opus Dei y recibió críticas por sus actos religiosos en las instituciones.

Tras el descalabro electoral en aquellas elecciones (tan sólo 2 diputados nacionales), en enero de 1983 se unió a Alianza Popular, partido del cual fue elegido presidente provincial en Barcelona ese mismo año.

[19]​ Finalmente, en noviembre de 1990, la ejecutiva dirigida por este último fue sustituida por una gestora encabezada por Vidal-Quadras en Barcelona y en enero de 1991 lo mismo ocurrió con la ejecutiva regional, que fue relevada por una gestora dirigida por Josep Curtos, por lo que el ala dura del PP regional se hacía con el control de partido.

Durante la X Legislatura (2011-2015) fue investido Ministro de Interior en el Gobierno presidido por Mariano Rajoy, siendo su principal legado legislativo la Ley mordaza, que recibió fuertes críticas.

[13]​ En septiembre de 2020 la Fiscalía Anticorrupción elaboró un informe en el que, vistos los «muy numerosos y concluyentes» indicios contra Fernández Díaz en la Operación Kitchen de espionaje a Luis Bárcenas, pide al juez que cite a declarar como imputado al exministro junto con la exsecretaria general del PP, María Dolores de Cospedal.

En 1991, en un viaje oficial a Las Vegas (Estados Unidos), comenzó un camino de reconversión que culminó en 1997.