Su cuerpo probablemente estaba cubierto por plumas primitivas, pero estas no se han encontrado en el fósil, es decir, sin restos de piel.

Sólo se ha descubierto un ejemplar juvenil, notable por la preservación del tejido blando de sus órganos internos.

Entre los frontales y los parietales, el techo del cráneo en una distancia limitada aún no se ha cerrado, lo que resulta en una llamativa abertura en forma de diamante, una fontanela que se confundió por primera vez con el daño infligido al fósil durante la primera preparación.

En cambio, en general se curvan gradualmente, sólo los dientes más grandes muestran algo de "torcedura".

Los primeros cuatro tienen una sección transversal ovalada, el quinto está más aplanado cerca de su vértice.

El fósil ha conservado solo nueve vértebras de la cola, probablemente cincuenta o más habían estado presentes originalmente.

Excepcionalmente, con la decimotercera vértebra las dos apófisis costales, la parapófisis y la diapófisis, se colocan al mismo nivel.

La tercera y la cuarta costilla tienen extremos inferiores expandidos que en vida probablemente estaban adheridos a las costillas cartilaginosas del esternón, a su vez conectados al esternón que en el espécimen holotipo no se han osificado todavía.

[2]​ La escápula es relativamente recta y de seis a siete veces más larga que ancha, falta su extremo superior.

El hueso púbico apunta casi verticalmente hacia abajo y, por lo tanto, es "mesopúbico" u "ortopúbico".

La tibia tiene sólo una cresta cnemial débil, separada de su cóndilo externo por una ranura profunda y estrecha, la incisura tibial .

El tejido nervioso y la piel externa, incluidas las posibles escamas o plumas, están ausentes.

[2]​ Los tejidos blandos no están presentes en forma de huellas sino como petrificaciones tridimensionales, habiendo sido reemplazados por fosfato cálcico con asombroso detalle, incluso a nivel subcelular o como restos transformados de los componentes biomoleculares originales.

En 1998 se sugirió que esto podría representar los restos del hígado descompuesto, un órgano rico en sangre.

[2]​ El tracto digestivo se puede rastrear principalmente, ya sea porque los intestinos todavía están presentes o por la presencia de alimentos.

Cerca y ligeramente por encima, emerge una parte posterior del intestino que se ha interpretado como el yeyuno.

El material orgánico original ha sido reemplazado por pequeños globos huecos, cuyas paredes están formadas por cristales euédricos de apatita.

Delante del isquion derecho hay fibras musculares que van desde el pie isquiático en dirección al fémur.

[6]​ La popular revista Oggi apodó simultáneamente al animal Ciro, el nombre típico de un niño napolitano, una idea del editor en jefe Pino Aprile.

[9]​ Debido a que la tesis no se publicó, esto siguió siendo un nomen ex dissertatione y considerado inválido .

Las características de celurosaurioano incluyen el sacro largo más que en otros dinosaurios, una cola rígida, y una ulna combada.

Dal Sasso & Maganuco enfatizaron que, debido a sus restos escasos, la posición de Orkoraptor es tentativa.

Sin embargo, había algo de tierra seca, pero no se sabe cuán extensos o conectados estaban los varios terrenos.

[2]​ Sin embargo, también hay indicios de que los terrenos se interconectan regularmente para formar islas mucho más extensas, puentes terrestres que permiten la dispersión de animales mucho más grandes, como saurópodos y grandes terópodos.

Debido a su pequeño tamaño absoluto, Scipionyx habría podido mantenerse cuando la tierra seca se redujo.

[1]​[14]​ Partes de la tráquea , los intestinos , el hígado, vasos sanguíneos, cartílagos, vainas córneas, tendones y músculos estaban fosilizados en la fina piedra caliza.

El espécimen holotipo proporciona así información directa única sobre la fisiología de los dinosaurios no aviares, especialmente en lo que respecta a la digestión, respiración y ontogénesis.

[15]​ Las conclusiones de John Ruben, sin embargo, han sido cuestionadas por algunos científicos, como Lawrence Witmer, quien afirmó que el estudio tenía fallas.

Dal Sasso & Maganuco, sin embargo, rechazaron esta interpretación porque en las aves vivas el saco aéreo del abdomen posterior no fuerza a los intestinos hacia adelante.

A pesar de su corta edad, la cría podía caminar, como lo demuestra la completa osificación del hueso ilíaco.