La línea fue fundada por el duque Felipe de Schleswig-Holstein-Sonderburg-Glücksburg (1584-1663).La línea recibía su nombre por el Castillo de Glucksburgo, donde tenía su sede.Este ducado, a pesar de ser reconocido por el rey de Dinamarca y el Sacro Imperio Romano Germánico, y recibir sus asignaciones dinerarias por sus territorios de Schleswig y Holstein, era meramente titular y no era reconocido por los terratenientes locales.Posteriormente la familia renunciaría a esos derechos por completo y continuarían como duques titulares.Algunos años después de la muerte del último duque, Federico Guillermo Enrique, el título pasó vía el rey Federico VI a Federico Guillermo de Schleswig-Holstein-Sonderburg-Beck, quien fundó la línea menor de Schleswig-Holstein-Sonderburg-Glücksburg.
Escudo de armas de los Duques de Schleswig-Holstein-Sonderburg-Glücksburg.
El Castillo de Glucksburgo en Schleswig-Holstein, sede de las ramas familiares epónimas.
