El poblado es el sitio adonde nació el insurrecto Anastasio Aquino, quien el año 1833 acaudilló una sublevación en contra del gobierno salvadoreño, y también el lugar en el que se libró su última batalla en el río Güiscuyulapa.

[3]​ Otras insurrecciones se desataron en los años 1840 y 1846, por Petronilo Castro, esta última sofocada por Gerardo Barrios.

Los moradores decidieron atacar a Zacatecoluca en represalia, pero fueron disuadidos por el cura Narciso Monterrey.

Entre los edificios destacaban la Iglesia Parroquial, la iglesia del Calvario, el Cabildo con techumbre de teja, la escuela y el convento y «un panteón amplio con cercos de adobe, muy nuevo».

Santiago Nonualco es gobernado por un Concejo Municipal, el cual es pluralista ya que existe representación de más de un partido político, quienes toman las decisiones sobre el territorio en lo económico, técnico y administrativo, conformado por el Alcalde, un Síndico, 8 Regidores Propietarios y 4 Regidores Suplentes.