En 1864 fue elegido diputado nacional, por lo que se trasladó a Buenos Aires, pero renunció al poco tiempo.

Por influencia de Guillermo Rawson se hizo amigo del presidente Bartolomé Mitre, que le encargó la fundación del Colegio Nacional de San Juan.

No se destacó especialmente en el cargo, debido a que todo el ambiente político estaba centrado en las elecciones nacionales de ese año; y, enseguida, por la revolución que organizaban los partidarios de Mitre.

Fue director del Banco Nacional y poco después volvió a ser contador general de la Nación.

Logró imponer una fuerte austeridad y control de gastos, política que sería abandonada por el siguiente presidente, Miguel Juárez Celman.