Tiene una extensión de 74,2 km² y una 35 872 habitantes (INE 2024) en su término municipal, que aumenta considerablemente en época estival ya que posee 23 km de costa en el Mar Menor y 16 km en el mar Mediterráneo.

[2]​[3]​[4]​ Sus municipios colindantes son: Pilar de la Horadada, Murcia, San Pedro del Pinatar, Torre Pacheco, Cartagena (sólo en la zona de La Manga) y Los Alcázares.

También pertenece al municipio de San Javier la isla Grosa, con un pequeño islote a su lado, también volcánico, El Farallón, ambas situadas en el Mediterráneo frente a las playas de La Manga.

Sus cauces están más definidos en sus inicios, volviéndose más difusos en todo su tramo final Las playas están situadas en la pedanía de Santiago de la Ribera (que forma un continuo urbano con el pueblo de San Javier) y La Manga del Mar Menor desde el kilómetro 4 hasta el final de la misma, en la zona conocida como Veneziola.

[5]​[6]​ Véase también: Mar Menor#Problemas medioambientales Por su importancia geológica y ecológica, el municipio de San Javier cuenta con varios espacios protegidos de gran valor medioambiental.

La estación más próxima es Balsicas-Mar Menor, situada en Balsicas (Torre-Pacheco).

Además, prestan servicio las siguientes líneas interurbanas: Existe un ferry que conecta Santiago de la Ribera con La Manga del Mar Menor.

El municipio posee un Polideportivo Municipal, con buenas instalaciones deportivas, que son revisadas y renovadas cada año.

El municipio cuenta con un atleta que participó en los juegos paralímpicos de 2012 en Reino Unido, Stadskanaal (Holanda) ese mismo año y en Swansea, Reino Unido en 2014.

Hay deportes que poseen mucha fama en este municipio, entre ellos tenemos el fútbol, waterpolo, baloncesto, atletismo, natación, boxeo, pádel, tiro con arco, natación y rugby, entre otros.