[1] En 1778 fue ascendido a teniente de navío y fue asignado a la estación naval española de San Blas, en la costa del Pacífico del actual México.El 5 de mayo de 1790, Fidalgo zarpó con el San Carlos de Nutca rumbo al Prince William Sound y al Cook Inlet, en las costas alaskeñas, y algunas semanas más tarde, ancló frente a la actual Cordova.El 3 de junio desembarcaron en la costa del actual Orca Inlet, y, en una ceremonia solemne, Fidalgo erigieron una gran cruz de madera, reafirmado la soberanía española y nombrando la zona como Puerto Córdova.La expedición siguió adelante y encontró el principal asentamiento ruso de la época en la isla de Kodiak, en la actual bahía Tres Santos.No estaba claro si el puesto español en el Nootka Sound debería de ser cedido a los británicos y la labor de Fidalgo en bahía Neah era preparar una posible reubicación del puesto español en Nutca.El segundo al mando de Fidalgo, el piloto Antonio Serantes, fue asesinado y en represalia, Fidalgo ordenó un ataque a los makah, causando muchas bajas.El puesto de bahía Neah fue abandonado y Fidalgo fue llamado al Nootka Sound.
Fuerte español de san Miguel en Nutca, 1793.
Localización de los lugares de contacto españoles en el Pacífico Noroeste
