Forma parte de la frontera internacional entre Estados Unidos y Canadá.

La frontera en el océano Pacífico está formada por una línea entre el cabo Flattery y la isla Tatoosh (en Washington) hasta Carmanah Point (en la isla de Vancouver, en la Columbia Británica).

La frontera este es una línea continua que se extiende al sur desde Rosario Head a lo largo de la isla Whidbey hasta Point Partridge, dirección sur hasta Point Wilson (en la península Quimper).

Debido a que se encuentra expuesto a los vientos generalmente del oeste y a las olas del Pacífico, el mar y el tiempo en el estrecho de Juan de Fuca son, en general, más bravos que en las aguas más protegidas del interior.

El estrecho continúa sujeto a una disputa de fronteras marinas entre Canadá y Estados Unidos.