Culminando los procesos, Canches logró ser elegido como el primer presidente regional del Callao en la historia para el periodo 2003-2006.

[5]​ Renunció a la bancada de Gana Perú en febrero del 2015 tras discrepancias internas y luego se unió a la bancada Unión Regional conformada por parlamentario independientes[6]​ Para las elecciones generales del 2016, Canches se afilió al partido Alianza para el Progreso y postuló a la reelección como parlamentario sin lograr tener éxito.

[7]​[8]​ Luego, volvió a postular por cuarta vez al Gobierno Regional del Callao como miembro del partido Perú Nación en 2018 y quedó en el cuarto lugar de las preferencias tras el triunfo de Dante Mandriotti.

El 8 de agosto del 2023, Rogelio Canches falleció a los 69 años en el Callao.

[9]​ En condolencias tras su deceso, la alcaldía del Callao decidió declarar duelo los días 8 y 9 de agosto.