Más tarde fundó, junto con su esposa, el Partido Nacionalista Peruano.

De acuerdo con ello, Isaac dio a sus hijos nombres incaicos como Pachacútec, Ima Súmac, Cusi Coyllur o Antauro.

Se dictaminó la apertura del proceso por rebelión, sedición e insulto al superior.

[11]​ Durante el posterior gobierno de Alejandro Toledo, Ollanta Humala regresó a sus funciones militares, primero como agregado militar en Francia y luego en Corea del Sur.

[13]​ Durante la campaña política electoral de 2006, en la que Humala postulaba a la presidencia del Perú, fue acusado por la ejecución y desaparición de población civil en la zona roja, estos crímenes se habrían cometido durante los años 90 mientras Humala prestaba servicios en Huánuco con el seudónimo de «capitán Carlos Gonzales».

[28]​ Marcelo Odebrecht y Jorge Barata han asegurado que la constructora brasileña entregó US$ 3 millones para la campaña de Humala en el 2011.

Raymundo Trindade Serra, exgerente de relaciones institucionales de Odebrecht, le dijo a los fiscales peruanos que estuvo presente en al menos dos reuniones donde Jorge Barata le entregó US$ 1 millón a la ex primera dama en un departamento que Humala tenía en Miraflores.

[30]​ Humala tiene un fuerte liderazgo en la zona sur del país por su crítica al modelo neoliberal y a los partidos políticos tradicionales que, según él, no han logrado llenar las expectativas de la población.

Al 100 % de los votos escrutados por la Oficina Nacional de Procesos Electorales se confirmó que la segunda vuelta sería entre Ollanta Humala y el candidato por el APRA, Alan García.

El 4 de junio Ollanta Humala tuvo que enfrentar al candidato presidencial del APRA, Alan García en la segunda vuelta electoral.

Ollanta Humala realizó campaña en Trujillo, ciudad eminentemente aprista, la última semana de abril.

Distintos medios de comunicación peruanos opuestos a Ollanta Humala, señalaron en determinado momento que el periodista canario Ramón Pérez Almodóvar estaría asesorando al candidato presidencial para la segunda vuelta electoral,[31]​ acusación que fue desmentida por el periodista, si bien admitió estar participando en la campaña.

El domingo 21 de mayo y tras largas coordinaciones, Ollanta Humala afrontó su primer debate presidencial ante el candidato del Apra, Alan García Pérez, la polémica que se transmitió por Televisión Nacional del Perú y se dividió en cinco puntos.

Sin embargo llamó luego a sus seguidores a formar el "Frente Nacionalista Democrático" que proponía la unión de los sectores sociales, para exigir al nuevo gobierno aprista que cumpliera sus promesas, pero fue criticado por incluir en dicha coalición a sectores de izquierda radical representados por el Movimiento Nueva Izquierda.

[33]​ Para estas elecciones, conformó la alianza electoral «Gana Perú», en torno al ya existente Partido Nacionalista Peruano.

[35]​ Debido a que no logró superar el 50 % de los votos válidos, pasó a una segunda vuelta con la candidata Keiko Fujimori, que se realizó el 5 de junio.

Al igual que en la campaña presidencial del año 2006, Humala fue criticado por un presunto vínculo con el presidente venezolano Hugo Chávez.

Sin embargo, Humala aseguró que no buscaba aplicar el modelo venezolano en el país, distanciándose así de Hugo Chávez,[36]​[37]​ y poniendo más bien como referente al expresidente brasileño Luiz Inácio Lula da Silva.

Algo semejante no ocurría desde 1963, cuando el parlamento censuró al gabinete presidido por Julio Óscar Trelles Montes.

Aparte del premier, solo hubo tres cambios: Jakke Valakivi Álvarez (Defensa), Gustavo Adrianzén Olaya (Justicia y Derechos Humanos) y Ana María Sánchez Vargas de Ríos (Relaciones Exteriores).

[61]​ 5.º año La empresa Brasileña Odebrecht admitió haber entregado 3 millones a la campaña presidencial del 2011 del entonces candidato, Ollanta Humala, el dinero habría salido de la Caja 2 de Odebrecht y se habría dado 2 millones a Nadine Heredia, esposa del expresidente y 1 millón al publicista Brasileño, Valdemir Carreta.