Con el club norteño se mantuvo hasta 1981, para regresar una vez más a Sagrada Familia, recién ascendido ese año.
Marcó un total de 30 goles en el campeonato nacional, cifra bastante significativa para un defensa.
[1] Como jugador, se le recuerda por su liderazgo y seguridad en el campo, así como por sus excelentes coberturas defensivas.
En Segunda División fue técnico de la Barrio México, en las temporadas 2007 -2008 donde logró el subcampeonato en 2008.
Fue la primera copa en la que participó su país y el equipo nacional logró la hazaña histórica de la clasificación para la segunda ronda, contra todo pronóstico, superando a equipos aparentemente mucho más fuertes como Escocia,[2] Brasil,[3] y Suecia, país que e incluso le metió un gol para dar la victoria para Costa Rica (2-1),[4] en el último partido, Flores apareció también contra la Selección de Checoslovaquia en el que fueron derrotados por un marcador superior ante Checoslovaquia 4-1.
[6][7] Siendo seleccionado ganó el I Torneo de la Copa Centroamericana UNCAF, en el año 1991.