Quintanilla toma su nombre de una casa de campo, denominada quinta o quintana, cuyos colonos pagaban la quinta parte de los frutos recogidos.
A la caída del Antiguo Régimen la localidad se constituye en municipio constitucional, conocido entonces como Quintanilla Tres Barrios, en la región de Castilla la Vieja[3] que en el censo de 1842 contaba con 37 hogares y 150 A finales del siglo XX[4] este municipio desaparece porque se integra en el municipio de San Esteban de Gormaz, contaba entonces con 93 hogares y 341 habitantes.
Población de derecho según los censos de población del INE.
Población de hecho según los censos de población del INE.En este censo se denominaba Quintanilla Tres Barrios: 1842.Entre el Censo de 1970 y el anterior, este municipio desaparece porque se integra en el municipio 42162 (San Esteban de Gormaz).
[6] En el año 1981 contaba con 229 habitantes, concentrados en el núcleo principal, pasando a 95 en 2010, 64 varones y 31 mujeres.