Proteínas de unión al ADN

Sin embargo, existen algunos ligandos de unión al surco menor del ADN conocidos como netropsina,[6]​ distamicina, Hoechst 33258, pentamidina, DAPI y otros.

Las proteínas estructurales que se unen al ADN son ejemplos bien conocidos de interacciones proteína-ADN no específicas.

En eucariotas, esta estructura implica la unión del ADN a un complejo de pequeñas proteínas básicas llamadas histonas.

[10]​ Las modificaciones químicas que pueden sufrir estos residuos de aminoácidos básicos incluyen metilación, fosforilación y acetilación.

[14]​[15]​ Estas proteínas son importantes para plegar grupos de nucleosomas y organizarlos en estructuras mayores que finalmente dan lugar a los cromosomas.

Por el contrario, otras proteínas han evolucionado para unirse a secuencias de ADN específicas.

En primer lugar, pueden unirse a la ARN polimerasa responsable de la transcripción, ya sea directamente o mediante otras proteínas mediadoras; esto ubica la polimerasa en el promotor y le permite comenzar la transcripción.

[18]​ Alternativamente, los factores de transcripción pueden unirse a enzimas que modifican las histonas en el promotor.

Experimentos recientes de molécula única demostraron que las proteínas de unión al ADN se vuelven a unir rápidamente para que dicha unión se produzca en la orientación correcta y así reconocer la secuencia diana.

Interacción del ADN (naranja) con las histonas (azul). Los aminoácidos básicos de estas proteínas se unen a los grupos fosfato ácidos en el ADN.
El represor del fago lambda es un factor de transcripción con un dominio HTH que se une a su ADN diana. [ 1 ]
La enzima de restricción EcoRV (verde) formando un complejo con su ADN diana. [ 2 ]