Como con todos los otros principados eclesiásticos del Sacro Imperio Romano, es importante distinguir entre el principado eclesiástico de Münster y la diócesis de Münster aunque ambas entidades fueran gobernadas por el mismo individuo.

Las diócesis eran generalmente más grandes que los principados eclesiásticos correspondientes y tenían partes que se extendían más allá del principado eclesiástico, donde la autoridad de príncipe-obispo era estrictamente la de un obispo ordinario y limitada a los con asuntos espirituales.

El primer obispo fue Ludgero, quien, desde el año 787, había sido un entusiasta misionero en los cinco «hundreds» (distritos) frisios.

La diócesis también incluyó distritos alejados de su territorio principal, es decir, los cinco hundreds frisios en el bajo Ems (Hugmerki, Hunusgau, Fivelgau, Federitgau y Emsgau).

El siglo XII estuvo marcado por un crecimiento considerable del poder secular de los obispos.

Entre estos, el cabildo catedralicio aparece temprano en el siglo XIII; Más tarde, la nobleza inferior y, por último, la ciudad de Münster.

Con el transcurso del tiempo el cabildo aumentaría sus derechos gracias a los acuerdos hechos con los obispos antes de la elección.

La conducta arbitraria del obispo Enrique II de Moers había despertado un sentimiento muy amargo en la ciudad.

Esto provocó una larga batalla diplomática en cuanto a su sucesor entre las potencias católicas y protestantes, durante la cual el obispado fue administrado por Cléveris.

La parte occidental del distrito frisio bajo la jurisdicción eclesiástica de Münster fue transferida, en 1569, a los obispados recién fundados de Groninga y Deventer, lo cual hizo que se convirtieran al protestantismo.

En 1803 el obispado, con cerca de 310 000 habitantes, fue secularizado por la Reichsdeputationshauptschluss y dividido en numerosas partes.

Las otras partes se dieron como compensación a los antiguos gobernantes de los territorios al oeste del Rin: Arenberg, Looz-Corswarem, Salm y Croÿ, que se habían convertido en parte de Francia.