El Premio Nacional de Ciencias Exactas de Chile fue creado el año 1992 como uno de los reemplazos del antiguo Premio Nacional de Ciencias bajo la Ley N.º 19.169.

Los otros dos premios en este mismo ámbito son Ciencias Naturales y Ciencias Aplicadas y Tecnológicas.

Forma parte de los Premios Nacionales de Chile.

El jurado está compuesto por el Ministro de Educación, que lo convoca, el Rector de la Universidad de Chile, el presidente de la Academia Chilena de Ciencias, un representante del Consejo de Rectores y el último galardonado con este premio.