Según el historiador boyacense, Cayo Leonidas Peñuela, un amigo de la familia Pinzón, sus padres fueron Juan Crisóstomo Pinzón Segura y Eusebia Romero Romero.

Abuelos paternos: Luis Pinzón y Petronila Segura; abuelos maternos: Manuel Romero y Gertrudis Romero.

[cita requerida] Pinzón se destacó durante finales del siglo XIX colombiano como uno de los líderes militares más sobresalientes.

Sin embargo, en desacuerdo con las políticas continuistas de los nacionalistas dirigidos por Caro, Pinzón se vinculó al bando histórico del conservatismo.

Esto lo marginó de la actividad política y militar cuando estalló en 1899 lo que se vendría a conocer como la Guerra de los Mil Días.