En marzo de 1936, las nuevas autoridades nombraron gobernador del Banco de España a Luis Nicolau d'Olwer, que se mantuvo en su puesto durante toda la Guerra Civil.

[2]​ Pan gestionó desde el primer momento lo que sería el Banco de España en Burgos, central del Banco en la zona gestionada por los militares golpistas, ejerciendo en ella como gobernador en funciones.

Junto con los consejeros que se habían pasado a la zona franquista, Pan organizó la administración del Banco de España del bando franquista.

Cada administración realizó sus propias emisiones de billetes y facilitó a sus respectivos Gobiernos el dinero necesario para sostener los gastos de la guerra.

La nota de prensa añadía que con esa fecha había sido cesado el subgobernador, "jubilándolo", Pedro Pan Gómez, "y nombrado para sustituirle a don Ramón Artigas".