Asistió a la escuela media, en el Colegio Jesuita St Jozef, en Turnhout, después de lo cual decidió seguir los pasos de su padre y convertirse en médico.Durante la Segunda Guerra Mundial, Janssen estudió física, biología y química en la Facultad universitaria de Notre-Dame de la Paix (FUNDP) en Namur.Janssen se graduó en medicina por la Universidad de Gante en 1951.En 1953, descubrió su primer fármaco, la ambucetamida, un antiespasmódico, encontrándose que era particularmente efectivo para el alivio de dolores menstruales.Luego abandonó la universidad; y, en 1956 estableció la empresa que se convertiría en Janssen Pharmaceutica.
