Fue el cuarto hijo del maestro de escuela y pedagogo, Carl Kehr.
En 1879 se graduó en la escuela secundaria de Halberstadt cuyo director, Gustav Schmidt, tenía gran interés en la diplomática y publicaría junto a él, posteriormente en 1889, documentos papales y los regesta de Sajonia (1353 a 1378).
Durante el mismo año, le nombran presidente del centro director de los "Monumenta Germaniae Historica", desde 1919 a 1934, así como director del Instituto para Historia alemana Káiser Wilhelm[2] donde estuvo de director hasta 1941.
Se casó con Doris vom Baur en 1908 con la que tuvo una hija, Gudila, casada con el historiador social Götz Freiherr von Pölnitz.
Kehr es más conocido por su investigación documental sobre el Papado y sobre la historia imperial alemana.