Hijo de Francisco Encina Echeverría y Javiera Romero.
Padre del historiador Francisco Antonio Encina.
Desde su juventud sufrió una grave afección estomacal, por lo que debió abandonar sus estudios de abogado en la Universidad de Chile, dedicándose a los negocios familiares.
De regreso a Chile, fue miembro del Partido Nacional, teniendo además una participación activa en la Revolución de 1891, donde fue gravemente herido.
Retirado ya de la política, falleció en su fundo El Trapiche en 1900.