Durante estos años son designados Socios Honorarios del Orfeón personajes destacados del mundo musical como Joaquín Gaztambide, Emilio Arrieta, Hilarión Eslava, Juan Guelbenzu o Dámaso Zabalza.

1873 es la fecha en se pone el final a este primer Orfeón por motivos fundamentalmente económicos.

Estos años coinciden con la tercera guerra carlista (1872-1876) factor que la Enciclopedia Navarra reseña como causa también de la disolución.

En los programas, conviven las actuaciones musicales con otras literarias como charlas y conferencias, recitación de poemas, teatro e incluso magia.

En 1885 se suspende indefinidamente esta agrupación, por falta de asistencia a ensayos, ratificándose y disolviéndose definitivamente dos años después.

La mujer estará presente casi desde los orígenes en el Orfeón participando en ocasiones especiales (como en los coros de zarzuelas o galas líricas).

[13]​ En 1906, ya como coro mixto, actúa en la Boda del Rey Alfonso XIII con doña Victoria Eugenia de Battenberg.

[17]​ En el año 1928 el compositor francés Maurice Ravel dirige al Orfeón Pamplonés para interpretar sus Tres obras para coro: Nicolette, Trois oiseaux du paradis y Ronde (1915).

Juan Eraso será el siguiente director del Orfeón (1956-1960), en los que inculca un estilo propio dentro del campo coral, con una impostación más moderna y un perfeccionamiento vocal que llevarán al conjunto a interpretar multitud de conciertos a capela.

Durante esta etapa se incrementan los conciertos realizados en auditorios franceses: Saint Emillion, Burdeos, Toulouse, Bayona o París donde el coro interpreta la Misa Mozárabe y se graba la Misa Ducal de Cristóbal Halffter.

Esta grabación propiciará una fructífera colaboración entre el Orfeón y Halffter que será nombrado Director Honorífico de la institución.

Durante sus siete años Pírfano llevará al Orfeón a los grandes festivales musicales, nacionales e internacionales.

Con ellos el público navarro podrá escuchar la vanguardia musical de producción propia.

Alfonso Huarte (1998-2005) es el primer maestro que cuenta con un equipo profesional de gerencia.

Con "Carmina Burana" comparte un espectáculo con la Fura dels Baus, que escenifica la obra con una fuerte carga audiovisual.

Ha sido dirigido por Zubin Mehta, con la orquesta y coro del Mayo Musical Florentino, y recientemente se ha llevado a Chile, donde más de diez mil personas han podido disfrutarlo.

Fue algo espectacular para los afortunados que pudieron disfrutarlo en el Palacio de Carlos V.

Pero los sueños de repetir el acontecimiento no cayeron en saco roto y la efemérides se produjo tres años más tarde.

En agosto del 2023 en la Quincena Musical Donostiarra podrán escuchar nuevamente la Octava de Mahler (esta vez sólo con los dos Orfeones como coro) quienes no hayan podido conseguir entradas para el Auditorio Nacional.