Su tesis de Doctorado sobre las relaciones entre el Estado y la Enseñanza Privada por contrato se ha convertido en una referencia en la materia.

Nicole Fontaine ha escrito varios libros sobre la labor del Parlamento Europeo.

Repensar Europa), en colaboración con François Poulet-Mathis, presentando su programa de acción diplomática, política e institucional, que fue seguido por el presidente Macron.

Dirigente del movimiento católico familiar, Fontaine fue una de las principales artífices para protestar contra el proyecto socialista y comunista defendido por Françoise Mitterrand de crear una sola escuela nacional, única, laica y republicana.

En julio de 1989 obtuvo la reelección como eurodiputada en la lista centrista encabezada por Simone Veil, y fue elegida Vicepresidenta del Parlamento Europeo (1989-1994).

Posteriormente, como miembro del movimiento federalista francés, próxima a la democracia cristiana, continuó trabajando por la construcción política europea, a través de la cátedra Jean Monnet de la Unión Europea.