Durante la guerra el museo fue cerrado, pero posteriormente se reabrió y gracias al Rector de Plinio Fraccaro amplió sus colecciones.En la Sala Scarpa, la actividad de estudio desarrollada en Pavía en el campo de las ciencias matemáticas, naturales y químicas está atestiguada por exposiciones relacionadas con científicos como Vincenzo Brunacci, Lazzaro Spallanzani y Louis Valentino Brugnatelli.La pieza de la colección que más curiosidad despierta es la cabeza del anatomista Antonio Scarpa conservada en alcohol en una vitrina.[5] Un pequeño escaparate está dedicado a Paolo Mantegazza, una figura influyente en la antropología e historia italianas que fundó una pequeña práctica de patología experimental en la Universidad de Pavía en la que se formó Camillo Golgi.Posteriormente se anexaron al museo el Teatro de Física (hoy Aula Volta) y una torre para observaciones meteorológicas.También agregó instrumentos que había diseñado y creado con la ayuda de hábiles artesanos.Volta utilizó muchas herramientas durante las exposiciones públicas, organizadas dos veces por semana de diciembre a junio.Esta enorme colección fue ampliada aún más por sus sucesores, Giovanni Cantoni y otros que lo siguieron.
Una de las salas del museo médico.
Algunos de los instrumentos quirúrgicos diseñados por Giovanni Antonio Brambilla (segunda mitad del siglo
XVIII
)