Cuenta con material antropológico de los Onas y los Yámanas.

El museo está compuesto por varias salas, exhibición al aire libre y tres edificios antiguos, declarados de Monumento Histórico de interés nacional en 1983.

[3]​[4]​ Debe su nombre en honor al sacerdote católico de la orden salesiana Monseñor José Fagnano, quien fuera el primer Administrador Apostólico de la Patagonia Meridional, Tierra del Fuego y Malvinas con sede en Punta Arenas.

Cuenta un grupo de carretas y carretones.

También posee información sobre los salesianos en la Patagonia Argentina, Monseñor Fagnano, el barco Amadeo, la goleta María Auxiliadora, Luis Piedrabuena, etc.[5]​[4]​[2]​