Se encuentra organizado en catorce salas en dos plantas, expone sobre todo escultura, entre ellas el famoso Auriga de Delfos y elementos arquitectónicos o ofrendas.

Además de la exposición, que abarca 2.270 m², los fondos y salas de conservación (mosaico, cerámica y orfebrería) ocupan espacios que llegan a los 558 m².

[3]​ El edificio original, de dos alas, se amplió entre 1935 y 1936, y nuevamente en 1958 por Patroclos Karantinos para alojar la colección, siempre creciente, con nuevos hallazgos.

También se intentó canjear objetos almacenados, como la clásica fachada del Templo de Apolo.

[4]​ El museo está dedicado a la preservación de los hallazgos del yacimiento arqueológico del santuario de Apolo y alrededores, incluyendo elementos arquitectónicos, estatuas y objetos votivos que datan desde la prehistoria hasta el final de la Edad Antigua, con una mayor concentración de piezas provenientes del momento en que el templo disfrutaba de su mayor prosperidad e influencia entre el periodo arcaico y la época romana.