A este municipio también se le hace llamar popularmente, "La Perla de la Chontalpa".

[5]​ Su cabecera municipal es la ciudad de Comalcalco y cuenta con una división constituida, además, por 16 colonias urbanas circundantes, 30 ejidos, 90 rancherías, 2 poblados, 5 fraccionamientos, 3 villas y 2 ciudades.

Esto coloca al municipio en el décimo lugar en extensión territorial.

Comalcalco es y ha sido un municipio eminentemente agrícola, siendo el primer productor de cacao y chocolate de la República Mexicana; aun cuando Petróleos Mexicanos cuenta con muy importantes instalaciones y pozos en producción en el municipio, Comalcalco no ha perdido su fisonomía ni ha dejado de ser un municipio agrícola.

En 1525, en su viaje a Las Hibueras (Honduras), el conquistador Hernán Cortés pasó por el territorio del hoy municipio de Comalcalco, llegando a lo que en ese entonces los españoles llamaban Provincia de Cupilco o Cupilcom la cual según Cortés estaba en paz.

Al paso del tiempo a ese cause semiseco se le llamó "río Seco".

El gobernador del estado, a sus habitantes sabed: que el Congreso ha decretado lo siguiente: atendiendo a las particulares circunstancias de que se haya adornado el Pueblo Nuevo de San Isidro Comalcalco, según está acreditado por el expediente presentado por el Gobernador, deseoso de facilitar la más pronta administración de justicia así a éste como a sus pueblos, inmediatamente vecinos, ha venido en decretar lo siguiente: Artículo 1.- Se concede al Pueblo Nuevo de San Isidro Comalcalco la creación de su ayuntamiento constitucional.

Artículo 3.- Para la instalación del nuevo ayuntamiento se observará cuanto al efecto previene la constitución del estado, capítulo 9.º Sección 1.ª, de los ayuntamientos constitucionales, presidiendo la junta primera el presidente de la actual junta de policía del citado Comalcalco.

Con el decreto anterior, Comalcalco tuvo territorialidad convirtiéndose en municipio.

[9]​ El hecho más lamentable en esta derrota, fue la muerte del revolucionario tabasqueño Ignacio Gutiérrez Gómez.

[9]​ La orografía del municipio es plana con ligeras pendientes en dirección a la costa y escasas elevaciones que no sobrepasan los 40 m s. n. m. La conforman los ríos Cuxcuxapa, Seco, Tular y Cocohital.

Otros productos que se cultivan en el municipio son: Caña de azúcar, maíz, frijol, coco y papaya.

La ganadería es otro sector importante en la economía local practicándose esta actividad de manera extensiva.

Según el INEGI, en 1997 existían 36 409 bovinos; 22 244 porcinos; 2,713 ovinos; 3,371 equinos y 186 542 aves de corral.

La explotación petrolera es la actividad industrial más relevante, tanto por el ingreso como por los empleos que genera.

Uno de los corredores de línea más importantes que podemos mencionar es las baterías El Golpe I y II, Santuario, Tupilco I y II, [10]​[11]​ Planta Deshidratadora El Golpe, estaciones de compresión: Castarical, El Golpe, Santuario y Tupilco.

Es una de las iglesias más famosas y fotografiadas del estado, por lo que su imagen aparece siempre en artículos promocionales, folletos y en exposiciones del estado de Tabasco.