El MLN planteó como prioridades, el cambio de régimen, liberación de presos políticos, solidaridad con Cuba, autonomía municipal para sindicatos y organizaciones campesinas, presencia opositora en el Congreso, debilitamiento del presidencialismo y el socavado control corporativista.

En enero de 1963, Lázaro Cárdenas anunció la formación de tal partido, la Central Campesina Independiente (CCI) para atacar la corrupción del PRI y la traición a las luchas campesinas.

[8]​[7]​ Tras la negativa del MLN a declararse partido oficial para las elecciones, se creía que el grupo comenzaba un rápido declive.

El tema de la solidaridad con la Revolución cubana se convirtió en un punto polémico en el gobierno del entonces presidente Adolfo López Mateos.

Además el tema de los presos políticos, la liberación de Valentín Campa y Demetrio Vallejo, llevó a denunciar que el MLN, afirmando que había sucumbido a la infiltración comunista.