Vicente Lombardo Toledano fue designado como el primer Secretario General en la historia de esta Confederación.

Desde 2016 es dirigida por el exsenador Carlos Aceves del Olmo en sustitución de Joaquín Gamboa Pascoe quien falleció en el cargo.

Tiene como antecedente a la Confederación Regional Obrera Mexicana (CROM), en la cual los fundadores de CTM, estuvieron integrados por espacio de cinco años de 1924 a 1929, año en el que decidieron retirarse para conformar una nueva central.

Se constituye en primer término la Federación Sindical de Trabajadores del Distrito Federal.

El mismo Octavio Nicolás Fernández Vilchis, pionero del trotskismo en México expresa que la manera en la que se dio la fundación no fue la ideal.