Los cuerpos fructíferos de las especies de Morchella, incluyendo M. elata, son altamente polimórficos en apariencia, exhibiendo variaciones en forma, color y tamaño; esto ha contribuido a las incertidumbres en cuanto a la taxonomía.

Los primeros análisis filogenéticos apoyaron la hipótesis de que el género comprende sólo unas pocas especies con una considerable variación fenotípica.

Las especies del clado Elata (también llamadas Distantes), se caracterizan por el oscurecimiento gradual de sus crestas estériles al alcanzar la madurez, con la excepción de Morchella tridentina (=Morchella frustrata), que tiene crestas persistentemente pálidas.

[7]​ El nombre científico Morchella elata fue propuesto por Elias Magnus Fries de Europa en 1822.

proporcionaron nombres para muchas de las morillas negras norteamericanas que podrían haber sido denominadas M. elata en el pasado.

Sin embargo, dado que la verdadera identidad de M. elata aún no está totalmente aclarada, sus preferencias ecológicas exactas y su distribución siguen sin estar claras.