El programa se centra en los agentes especiales del FBI Fox Mulder (David Duchovny) y Dana Scully (Gillian Anderson) que trabajan en casos relacionados con lo paranormal, llamados expedientes X. Mulder cree en lo paranormal, mientras que la escéptica Scully ha sido asignada para desacreditar su trabajo.
Un escritor que vive al lado de Mulder está escribiendo una novela sobre los asesinatos antes de que sucedan y pronto, Scully se encuentra confundida y atraída por el escritor, quien tiene un interés romántico en ella.
Phillip Padgett (John Hawkes), un autor novato, se sienta en un escritorio y sufre un bloqueo de escritor.
Dana Scully (Gillian Anderson) más tarde se encuentra con el extraño cuando entra en un ascensor.
Mulder cree que el corazón fue removido con una técnica conocida como cirugía psíquica.
La chica, llamada Maggie (Jillian Bach), corre hacia el bosque para estar sola y Kevin (Angelo Vacco), su novio, la persigue.
Al día siguiente, Mulder y Scully discuten este último incidente por teléfono.
Scully descubre un sobre sin marcar en la oficina que contiene un milagro, un tipo de colgante.
Mientras Padgett está bajo custodia, Maggie es asesinada de la misma manera que Kevin.
El episodio se cierra con una voz en off del autor, explicando sus acciones finales.
[2] La idea detrás del episodio surgió cuando John Shiban y Frank Spotnitz discutían lo estresante que podía ser el ser un escritor de X-Files.
[3] El director Kim Manners buscó filmar la mayor parte del episodio «de manera muy simple», porque quería que «los personajes lo llevaran».
[10][11] La secuencia en la que Mulder corre fue filmada en una motocicleta; El personal de producción decidió usar motocicletas porque Duchovny había podido correr más rápido que dos caballos en el episodio de la cuarta temporada «Tunguska».
[12] Varios lugares que fueron explorados para el episodio resultaron difíciles de usar.
Originalmente se había creado para el primer episodio de la sexta temporada «The Beginning.
[17] The X-Files alquiló el espacio por varios días para filmar, por cinco mil dólares.
[18] Encontrar un cementerio con «lápidas verticales anticuadas» resultó ser un desafío para el gerente de locaciones Ilt Jones.
[3] La niebla en el cementerio se creó enterrando pequeños «vaporizadores» que producían vapor de agua.
Debido a que el vapor era frío, se pegaba al suelo, emulando las propiedades de la niebla real.
[22] El accesorio del milagro real se elaboró varias veces porque, según Manners, la cara era particularmente difícil de corregir.
Simonds, escritor y productor ejecutivo de ese programa, inicialmente no sabía que la lápida había aparecido.
[26] Otros, incluido Spotnitz, habían creído que la lápida era una referencia en broma al famoso autor J.D.
Kaner sugiere que Padgett representa una versión de Mulder, y que existe un paralelo directo entre ser un criminólogo —que debe pensar como el delincuente— y un escritor —que debe pensar como sus personajes.
[29] Al final, sin embargo, Padgett sacrifica su búsqueda personal, su manuscrito, para ser libre.
[30] El episodio también presenta un cambio de roles temporal para Mulder y Scully.
[29] Al basarse en la lógica empírica, Mulder está actuando de la forma en que Scully normalmente piensa.
Tom Kessenich, en su libro Examinations: An Unauthorized Look at Seasons 6–9 of the X-Files le dio al episodio una crítica positiva y escribió: «El poder de las revelaciones [de “Milagro”] fue asombroso.
Por esta razón, más tarde se incluyó en la compilación de DVD X-Files Essentials, junto con otros siete episodios.
Stegall señaló que «si “Milagro” tiene un mensaje sobre la percepción, se muestra en Scully, a quien se ve a través de los ojos de todos (Mulder, Padgett, incluso Naciamento) excepto el suyo propio.