«Tunguska» contó con apariciones especiales de John Neville, Nicholas Lea y Fritz Weaver.
Mientras tanto, en la ciudad de Nueva York, Mulder y Scully participan en una redada del FBI contra un grupo terrorista nacional.
Mulder viaja a Nueva York para visitar a Marita Covarrubias (Laurie Holden), quien le revela que el fragmento se originó en la provincia rusa de Krasnoyarsk y proporciona los documentos necesarios para viajar allí.
Skinner y los agentes están citados para comparecer ante el panel del senador Sorenson por la valija perdida; cuando Skinner le pregunta a Scully sobre el paradero de Mulder, ella no se comunica.
Los dos hombres se encuentran con un campo de trabajos forzados, pero son capturados por los capataces y arrojados a un gulag.
Inmediatamente después, los guardias irrumpieron en la habitación e inyectaron a Mulder una jeringa.
Cuando Mulder despierta, se encuentra en una habitación grande atada con alambre de gallinero junto con muchos otros prisioneros.
Decidieron crear una historia conectada con los gulags rusos, lo que condujo a la idea «natural» de que los rusos estaban experimentando por separado del Sindicato para crear una vacuna para el aceite negro.
El escritor de la serie, John Shiban, sintió que era natural crear una historia similar a una carrera armamentista entre Estados Unidos y Rusia, ya que la Guerra Fría había terminado unos años antes.
«Tunguska» marcó la cuarta aparición en la serie de Malcolm Stewart, quien había aparecido previamente en «Pilot», «3» y «Avatar».
Sin embargo, describió a «Tunguska» como «uno de los primeros episodios de mitología realmente desenfocados en la ejecución del programa», y descubrió que la trama del episodio no hacía avanzar la serie lo suficiente, y señaló que «por primera vez, Mulder siente menos como si estuviera conduciendo la acción y más como si fuera un mensajero».
[11] David Duchovny describió este episodio, junto con «Terma», como lleno de acción y «muy divertido».