En ella, ambos personajes se encuentran casados, y el personaje de Dessler empieza a cobrar una gran importancia en la trama, al estar encerrada en el hotel donde se ha liberado un virus mortal liberado por los terroristas.
Cuando se sube al coche para dirigirse a la UAT, este estalla provocando la muerte instantánea de Michelle.
Posteriormente, ayuda a gestionar las operaciones de búsqueda del fanático Syed Alí, hasta que finalmente la UAT logra encontrar una bomba nuclear en Los Ángeles.
Hacia el final de la temporada, Michelle debe intervenir durante un ataque bioterrorista a un hotel en Los Ángeles.
En esta temporada Michelle deja a Tony por los problemas con el alcohol en los que este había caído, pero es llamada a reemplazarlo en mitad de temporada como nueva directora de CTU, debiendo pasar sus diferencias.
Decide confiar en Tony según sus conocimientos, y aunque lo disimula delante de él, todavía siente algo.
Al enterarse del asesinato de David Palmer, Michelle le pide a Tony que se dirijan a la UAT para ayudar en todo lo posible, ya que tienen experiencia en atentados contra el presidente.
Audrey Raines le entregó su pésame a Bill Buchanan tras los eventos sucedidos, ya que los dos se habían conocido en Seattle.
Doce horas más tarde, Tony se encuentra con Henderson, el hombre que ordenó los asesinatos.
Su esposo de alguna manera sobreviviría al ataque pero guardaría un gran rencor contra los hombres que estuvieron detrás de esto, al punto que seis años más tarde orquesta una acuación como doble agente y topo reverso con el FBI y un grupo antifederalista dirigido por David Emerson para ganarse la confianza del hombre que orquestró los ataques y la conspiración Sentox, un empresario paramilitar llamado Alan Wilson.