Chloe ha aparecido en 125 episodios durante 6 temporadas, siendo el segundo personaje en tener más apariciones en la serie, solo por detrás de Jack Bauer.
Todo resulta ser un plan para reintroducir a Jack al cártel y permitirle obtener una poderosa arma vírica llamada Cordilla III.
En ese momento Chloe recibe información de urgencia indicando que el expresidente David Palmer ha sido asesinado.
Chloe se dirige rápidamente a la UAT, pero justo al llegar a su automóvil, recibe el llamado de Edgar, quien le dice que Tony y Michelle también han sido víctimas de un atentado, con un coche bomba.
Mientras esto sucede, la UAT recibe información que implica a Bauer como el asesino de Palmer.
Spencer creía estar trabajando para Asuntos Internos pero en realidad estaba siendo utilizado por Walt Cummings para llegar a Jack.
Posterior a esto, la UAT enfrenta un ataque cuando un terrorista trabajando para Vladimir Bierko logra infiltrar las instalaciones y liberar gas nervioso.
Su mejor amigo en la UAT, Edgar Stiles, no consigue resguardarse del gas nervioso, y ella queda traumatizada al verle morir sin poder hacer nada por ayudarle.
Chloe es arrestada pero escapa a casa de Bill Buchanan, quien había sido depuesto anteriormente.
Ante esta situación, Chloe coordina con Jack la peligrosa operación de infiltrarse en un helicóptero para secuestrar a Logan y forzar una confesión.
Dicho transmisor fue preparado por Morris O'Brian, exmarido de Chloe y al que ella decidió llamar.
Chloe comienza el día 7 trabajando junto a Bill Buchanan y Tony Almeida en una operación encubierta por fuera de las agencias del gobierno.
Su propósito es develar una conspiración entre un dictador africano, empresarios estadounidenses y miembros del gabinete para derrocar a la presidenta Allison Taylor.
Tiene inconvenientes para adaptarse a las nuevas tecnologías, por lo cual su jefe, Brian Hastings, desconfía de su capacidad; pero su superior inmediata, Dana Walsh, le brinda su respaldo.