El Metamidofos es un plaguicida prohibido en muchos países bajo todas las formulaciones y usos pues es nocivo para la salud humana y el medio ambiente.

Solo puede ser utilizado para la investigación o propósitos de laboratorio en cantidades menores a 10Kg.

[3]​ En el Circular CFP XXII emitido por la secretaría para el convenio de Rottendam se cita un estudio donde se observa una mayor toxicidad del metamidofós respecto al acefato: También ha sido expuesto en el mismo informe un estudio sobre el impacto ambiental del compuesto: