Aoki es considerado un economista neo-institucional que fue conocido por ser pionero en el desarrollo del análisis institucional comparativo, y sus trabajos en la teoría de la firma, el gobierno corporativo y el desarrollo comparativo del este asiático.
Para enfocarse en la investigación y desempeñar un rol más importante en las actividades internacionales,[1] se convirtió en profesor emérito de la Universidad Stanford en 2004.
Desde 2011 se desempeñó como investigador visitante principal en el Instituto del Banco Asiático de Desarrollo en Tokio.
Asimismo, Aoki fue el editor fundador del Journal of the Japanese and International Economies.
La investigación de Aoki lo convirtió en pionero y líder en análisis institucional comparativo.
[19][20] Utilizó ese marco para analizar cómo las instituciones evolucionan, por qué las estructuras institucionales son diversas a través de las economías, y qué factores conducirían los cambios o la rigidez institucionales.