Fue tío del general Manuel Cepeda Peraza, quien liberó la ciudad de Mérida de las fuerzas imperialistas durante la segunda intervención francesa en México.

[1]​[2]​ En 1828, Martín Peraza acompañó a Antonio López de Santa Anna cuando este se sublevó y proclamó a Vicente Guerrero presidente de México.

Después, en 1832, también estuvo con Santa Anna en la insurrección en contra de Anastasio Bustamante.

Estando en Tampico, Tamaulipas, tuvo que huir a los Estados Unidos cuando Santa Anna cambió al bando centralista y conservador, porque además de ser destituido de su puesto en la plaza, iba a ser aprehendido acusado de conspirar contra el propio Santa Anna.

Esos barcos sirvieron después para hacer frente a las fuerzas centralistas de México cuando estas atacaron Yucatán, para finalmente ser derrotadas en Tixpéhual.