Nacido en Liverpool, era el hijo más joven de una familia griega rica y cosmopolita.
La malaria y una inflamación grave de su ojo derecho interrumpieron su servicio en Macedonia.
Snowdonia y las Scottish Highlands, lugares más cercanos a su hogar, fueron frecuentadas por él.
Tal fue su afición que incluso cuando recorrió años más tarde la región de la línea divisoria de las aguas del Satlej-Ganges, él y amigos llevaban sus instrumentos e interpretaban piezas musicales en las paradas.
Volvió al Himalaya para una expedición más prolongada en 1933 y de nuevo en 1936.
La palabra inglesa "Tradition" referida a una persona de quien los presentes hablaban con respeto y deferencia, surgió repetidas veces en la conversación.
Por influencia del budismo, Pallis fue objetor de conciencia durante la Segunda Guerra Mundial.
Ya budista practicante desde 1936, Pallis fue iniciado entonces en una orden en Shigatse, Tíbet, cuando tenía 52 años.
Ofreció también su ayuda de otras maneras, por ejemplo con el joven Chögyam Trungpa.
Años más adelante, le pidió a Pallis que escribiera el prólogo al primer libro de Trungpa, Born in Tibet.
—Para más referencias sobre la relación entre Trungpa y Pallis, véase el artículo de Pallis “Discovering the Interior Life” publicado en The Sword of Gnosis: Metaphysics, Cosmology, Tradition, Symbolism (Nueva York, NY: Penguin, 1974)—.
Al mismo tiempo que Pallis escribía sobre budismo y religión en general, continuaba su carrera musical.
Merton escribió sobre el encuentro: "Marco Pallis estuvo ayer aquí... me alegró mucho conocerle."
Sus escritos están en parte inspirados por la obra de René Guénon, Ananda Coomaraswamy y Frithjof Schuon, a quienes Pallis conocía personalmente.
Después de su último viaje al Tíbet en 1947 vivió en Kalimpong, India durante varios años, volviendo a Inglaterra en 1952.
Pallis estableció entonces lazos duraderos con personalidades como la reina del Bhután y su familia, quienes le visitaron más adelante en Inglaterra.
Con Heinrich Harrer colaboró más tarde en denunciar al fraudulento escritor Lobsang Rampa.