En diciembre de 1866, debido a que su enfermedad le impedía retornar al Paraguay, se incorporó como teniente primero al Batallón 7.º de Infantería, organizando el general Wenceslao Paunero, en el que haría toda su carrera militar.

El 26 de agosto del mismo año fue ascendido a sargento mayor graduado.

El 24 de julio fue ascendido a sargento mayor efectivo.

En febrero de 1872 el Batallón pasó a Buenos Aires, y en abril al Fuerte General Paz, en la Frontera Oeste, siendo nombrado 2.º Jefe del Batallón.

En enero de 1875 volvió al Fuerte General Paz, donde permaneció entre 1875 y 1876, y el 8 de abril fue confirmado como jefe del 7.º Batallón.

En este punto, entre el 11 y el 14 de abril, fue sitiado por 3000 originarios en un área apenas superior a seis manzanas, atacados a toda hora, aún bajo lluvias torrenciales.

La gran concentración de indígenas sobre Freyre permitió que las demás divisiones ocuparan Trenque Lauquen, Carhué y Puán sin oposición.

Así refiere los acontecimientos de esos días el teniente Federico Zeballos, del 7.º Regimiento:

Cumplimentada esa primera etapa, el 2 de junio siguiente quedó formalmente fundada la logia, con el título distintivo de Luz del Desierto.

Sus primeras autoridades quedaron constituidas en la forma siguiente: Venerable Maestro (Presidente) Hipólito Girgois; Primer Vigilante, Marcelino E. Freyre; Segundo Vigilante, Enrique Godoy Quiroga; Orador, Luís l. Cerro; Secretario, Rosendo María Fraga; Tesorero Juan Martínez; Hospitalario: José Miró; y Director de Ceremonias, Dionisio Álvarez.