María Núñez vivió en Mogán hasta los 3 años y desde entonces reside en la urbanización Alborada de Maspalomas.
Su debut en la máxima categoría se produjo con el BM Ro’Casa Gran Canaria en 2005 con apenas 16 años de edad.
Durante la 2011/12, en la EHF Cup, Mar Alicante cayó en semifinales ante el Zalău rumano, teniendo Núñez y el equipo una destacada actuación.
Estos éxitos, vinieron en parte a las buenas actuaciones de Núñez en el pivote tanto en defensa como en ataque.
Finalmente en el decisivo y último partido, lograron una impresionante victoria ante Dinamarca por 29-22 para pasar por segunda vez en su historia a unas semifinales de un Europeo.
En la fase de grupos, comienzan ganando a Kazajistán, aunque luego pierden 28-26 ante la potente Rusia.
No obstante, el arbitraje fue muy cuestionado por diversas exclusiones dudosas para las españolas, y por una roja directa también muy dudosa a Carmen Martín.
En el aspecto individual, María jugó todos los partidos y anotó sólo 2 goles (la que menos marcó del equipo).
María jugó todos los partidos, aunque sólo marcó 2 goles, no obstante obtuvo un 100% de efectividad.
En el plano individual, María fue la jugadora de campo con menos minutos del combinado junto con Silvia Arderius, jugando 8 partidos y anotando apenas 1 gol.