Sin embargo María Teresa y su ministro Wenzel Anton Graf Kaunitz consideraron que la unión no era lo suficientemente conveniente para la joven.De esta forma Carlos fue obligado a abandonar definitivamente la corte, ofendido por la Emperatriz.Contra su voluntad, María Amalia fue comprometida y después desposada con el Duque Fernando I de Parma.El matrimonio también tuvo el apoyo del futuro José II, hermano mayor de María Amalia, cuya primera y muy amada esposa, Isabel de Borbón-Parma, había sido la hermana del duque Fernando.Finalmente, temiendo ser asociado a la desaprobación que tenía la Duquesa, Carlos III finalizó las relaciones con Parma.La duquesa siempre se opuso al control que ejercía su madre a pesar de la distancia.