Inés Menéndez Valdez, se la atribuye ser a la sazón “capitán de uno de los regimientos que están en el Ejército real del Alto Perú”; posteriormente por estar “entre la espada y la pared”, por los ambos bandos, decidió unirse a los independentistas.

Como su hermano Francisco se puso a las órdenes de Manuel Belgrano en el Ejército del Norte, destacando su participación en 1817 en la batalla de Tarija y en diversas batallas y combates en esta región.

Manuel, residente en Tarija, entre 1825 y 1826 estuvo en constantes luchas y conflictos contra los probolivianos, coronel tarijeño Bernardo Trigo Espejo y coronel irlandés Francis Burdett O'Connor, quienes por órdenes de Antonio José de Sucre, invadieron el territorio tarijeño comandando el ejército colombiano enviado por Sucre, dieron golpes de estados en las dos ocasiones, esto para anexar el territorio a la República de Bolivia (tal objetivo se cumpliría a finales de 1826).

Manuel y la población tarijeña sufrieron distintos atropellos y apresamientos por parte de los invasores, ya que él al igual que la mayoría de los tarijeños, era leal a la nación rioplatense y estuvo luchando por el territorio de Tarija.

Sufriendo el exilio más adelante, se dirigió a Salta, donde se casó con Dña María Agustina Zenarruza y Palacios, quien era hermana de Dña María Andrea Zenarruza y Palacios —mujer de D. Francisco Pérez de Uriondo—; Manuel en el matrimonio con María Agustina, tuvo un solo hijo: José Félix Pérez de Uriondo.