En 1806, la Audiencia lo comisionó para que reconociera las bodegas de Sonsonate, El Salvador, y las fortificara.
En 1824 fundó un colegio militar en el que impartía clases de matemáticas y ciencias militares.
Por orden del Gobierno Federal, ese mismo año viajó como pacificador al Estado de Nicaragua que estaba sumido en el caos debido a las cruentas luchas fratricidas alentadas por las diferencias políticas entre los liberales (calandracas) de León acaudillados por Cleto Ordóñez y los conservadores (timbucos) de Granada, Managua y El Viejo liderados por Crisanto Sacasa Parodi.
Retorna a Guatemala donde fue nombrado secretario de Guerra y comandante general del Ejército Federal.
Esta acción permitió que los sitiados de San Salvador derrotaran a los atacantes.