En la primera parte, donde no hace aparición física, se lo menciona durante la batalla entre Naruto Uzumaki y Sasuke Uchiha, cuando este último hace un comentario sobre un histórico enfrentamiento de Madara contra el primer Hokage, Hashirama Senju.En una época definida por la guerra, todo lo que hizo fue la batalla, y todavía buscaba a ser aún más fuerte.El Mangekyō Sharingan tenía muchas consecuencias por su uso, una de ellas era perder la vista, Madara mantenía activo su Mangekyō Sharingan todo el tiempo y como resultado perdió la vista y se trasplantó los ojos de su hermano herido de muerte, para así poder rehabilitar su visión y obtener el Mangekyō Sharingan eterno.Aunque Madara no quería la paz con los Senju, el resto del Clan Uchiha querían poner fin a los combates, y Madara no tenía más remedio que estar de acuerdo con su decisión.[4] Contra los deseos de Madara, los habitantes del pueblo eligieron como primer Hokage a Hashirama .Madara temió que Hashirama oprimiera a los Uchiha, y trató de conseguir apoyo para desafiar su liderazgo.Aunque señaló que en un principio no le sucedió nada, cuando estaba llegando al final de su vida natural, despertó el Rinnegan.También adquirió el Elemento Madera y como tal poseía el ADN Uchiha y Senju, cuando despertó estos ojos obtuvo la capacidad de convocar la Estatua Demoníaca del Camino Exterior, la que uso como un catalizador para cultivar las células de Hashirama Senju.Madara luego le ordena al Zetsu Blanco y un clon espiral de Zetsu con la tarea de custodiar a Obito y ayudarlo con su rehabilitación, por lo que podría ser útil para él en el momento en que se despertó.Luego pasó a enseñarle varios Kinjutsus Uchiha, los del Rinnegan y el Elemento Yin-Yang.Sin embargo, Orochimaru y más tarde Kabuto Yakushi habrían descubierto la verdad detrás del sujeto enmascarado que se hacia pasar por Madara, luego de que estos buscaran las respuestas en el Valle del Fin sobre su muerte verdadera, logrando encontrar y traer devuelta al malvado Uchiha mediante el jutsu del Edo Tensei para chantajear a Obito, donde este último inicialmente se sorprende de esta revelación y le exige saber a Kabuto de donde fue que saco el cuerpo original de Madara, cuya única ubicación solo la conocía Obito, pero Kabuto le asegura que no le revelaría este secreto a nadie, siempre y cuando acepte trabajar con él.Tsunade, por su parte, duda que Tobi en realidad sea Madara Uchiha y que solo esté usando su nombre porque el nombre de 'Madara Uchiha' es sinónimo de poder mientras Obito llevaba a cabo sus planes.Madara había dominado su Sharingan a temprana edad, y recibió elogios por ello.Su hermano, despertó el suyo poco después de Madara, utilizó este poder nuevo y profundo para hacerse cargo del clan Uchiha.También se le ha visto manejando varias espadas a la vez en toda su vida desde sus días en el campo de batalla e incluso mostró maestría con ellas.
