El hermano mayor nació con los ojos del sabio, la fuerza del chakra y la energía espiritual, creyendo que la fuerza era el único medio para traer la paz.
Los Uchiha poseen un enorme y especial chakra además del Sharingan.
No obstante algo le ocurrió al cuerpo de Madara, el uso de su Mangekyō Sharingan lo llevó a estar postrado en una cama, desesperado por hallar la luz su hermano Izuna le ofreció sus ojos, lo que le permitió obtener un Mangekyō Sharingan eterno, aunque tiempo después fue juzgado por su clan.
Madara temiendo que la desventaja de su clan los llevara a la ruina protestó, pero su propio clan le dio la espalda y le llamó avaricioso, echándole en cara la mutilación de su hermano, Madara abandonó la aldea entonces para volver posteriormente y desafiarla, tras la épica batalla con Hashirama en el Valle del Fin, el poderoso Uchiha fue derrotado y dado por muerto.
En Konoha el sucesor de Hashirama, su hermano menor y segundo hokage Tobirama Senju como muestra de confianza le dio el poder policial al clan Uchiha al tiempo que vigilaba con ANBU a dicho clan.
Es por eso que comenzaron a planear un golpe de Estado para cambiar esta situación e incluso infiltraron a un espía entre los ANBU, el propio hijo del líder, el portentoso Itachi Uchiha.
Sin embargo este odiaba la guerra y comprendiendo la inestabilidad que produciría una lucha interna por el poder, prefirió ser leal a Konoha.
Itachi finalmente abandona la villa como un criminal extremadamente peligroso y entra en la Organización Akatsuki de Madara para proteger la aldea desde dentro.
Según Obito Uchiha, Fugaku lideraba el movimiento del clan para realizar un Golpe de Estado a Konoha, ya que los consejeros del Hokage y Danzo sospechaban que los Uchiha eran los responsables del ataque de Kurama y de la muerte del Cuarto Hokage, Minato Namikaze y su esposa Kushina Uzumaki, Fugaku para llevar adelante el Golpe de Estado infiltró a su propio hijo Itachi como espía en los ANBU, no obstante su plan falló, ya que Itachi prefirió ser leal a Konoha y por orden de Danzo recibió la orden de exterminar a todo su clan, todo esto sin la aprobación del Tercer Hokage.
El hermano menor de Madara Uchiha, desarrolló junto a su hermano el Mangekyō Sharingan y fue el segundo al mando del clan su poder era comparable al de Madara Uchiha, hay rumores de que fue asesinado por su hermano mayor Madara Uchiha, pero hay otra versión que dice que le ofreció sus ojos luego que Madara cayera en su inevitable ceguera por el uso excesivo de su sharingan y murió posteriormente en el transcurso de una batalla.
En el capítulo 624 del manga, se revela que fue Tobirama Senju el que hirió de gravedad a Izuna y a causa de esto murió.
Es una de las pocas personas que sabe reconocer a Sasuke, aunque asegura que su esposo siempre habla de su hijo menor cuando está con ella y se sabe que conocía a Kushina Uzumaki con quien se encontró el día del nacimiento de Naruto e incluso le presentó a su recién nacido hijo Sasuke a quien Kushina confundió con una niña, posterior al ataque de Kurama y durante una visita al hospital de Konoha ella observó con tristeza al pequeño Naruto y dedujo que su amiga Kushina había muerto en el ataque y había dejado a su hijo recién nacido huérfano.
Durante el tiempo que estuvo en Konoha en su entrenamiento como genin formó parte del Equipo 7 liderado por Kakashi Hatake, junto a su pareja Sakura y Naruto.
Más tarde, Orochimaru sella a Sasuke con su sello maldito (porque el quería apoderarse de su cuerpo), el cual le proporciona un intenso chakra extra, pero pierde su control mental.
Este le dijo a Sasuke Uchiha que lo había matado para obtener el Mangekyō sharingan.
En el capítulo del manga 459 se descubre que él podía controlar a cualquier persona sin que esta se diera cuenta y al parecer el chakra que liberan las partes vendadas de Danzō son del mismo color que las de Shisui y es descubierto por Ao, un ninja de la niebla gracias a su ojo Byakugan que poseía durante la reunión de los kages, dando a entender que Danzō habría trasplantado el Sharingan de Shisui a sí mismo pudiendo usar el dojutsu del Uchiha para su propio beneficio en la reunión.
Más tarde, en el manga, Itachi explica que su Mangekyō Sharingan tiene una habilidad especial, un Genjutsu muy poderoso llamado Kotoamatsukami, cuyo efecto es implantar una orden en la mente del usuario sin que este se dé cuenta y pueda oponerse.
Manga 550, en el manga se revela que Shisui Uchiha realmente se suicidó con la intención de que su amigo Itachi despertara el Mangekyō Sharingan, pero antes de morir le regaló su ojo Sharingan izquierdo a Itachi para proteger a la Aldea Oculta de la Hoja y de esta forma evitar que Danzō pudiera obtenerlo, ya que el ojo derecho se lo arrebató Danzō cuando encontró a Shisui Uchiha herido y que no se detendría hasta robar el otro ojo.
Despertó su Sharingan a muy temprana edad, pero no podía controlarlo bien y su uso le provocaba desmayos.
Tajima hizo su aparición en el campo de batalla junto a su hijo, Izuna, después de descubrir que su otro hijo, Madara, se estaba reuniendo con Hashirama Senju en un punto frecuente.