Aunque Obito no aparece por primera vez hasta que los capítulos especiales de la serie se centran en su vida como niño ninja, hace un cameo en la portada del capítulo 16 del manga con Kakashi Hatake.Kishimoto dijo que para el capítulo 16 había concebido una historia sobre Obito siendo un Uchiha y cómo afectaría a Kakashi.Kishimoto dijo que basó a Akatsuki en organizaciones similares de la vida real.[6] El diseñador de personajes Tetsuya Nishio se sorprendió con los múltiples diseños que tenía Obito a lo largo de la serie, y notó paralelismos entre él y Naruto en su infancia e inocencia.[11] En el anime, se demostró que Obito mantenía este engaño, incluso cuando no había nadie alrededor.[15] Durante la Cuarta Guerra Mundial Ninja, Obito se fijó en Naruto,[16] quien le recordaba a sí mismo en su juventud.Vestía un traje azul oscuro con ribete naranja, cuya espalda estaba adornada con el símbolo del clan Uchiha; llevaba la banda de Konoha y tenía placas protectoras de metal atadas a sus muñecas, similar a las que tenía Kakashi.Tras su presunta muerte, utiliza la túnica negra decorada con nubes rojas característica de los Akatsuki, dejándose crecer el pelo, para luego cortárselo.En su niñez, durante la Tercera Guerra Mundial Ninja, Obito quería convertirse en Hokage y esta enamorado de Rin, su compañera.[28][29] Él se enfrenta a Naruto y Kurama, quienes detienen los Seis Caminos del Dolor para luego Obito reivir al Diez Colas.[30] Kabuto luego revive al verdadero Madara y Obito revela su verdadera identidad a lo que Kakashi se sorprende.[33][34] Un Obito culpable intenta redimirse reviviendo a todos los que murieron en la guerra, solo para ser poseído por el Zetsu negro.Obito muere mientras protege a Naruto y Kakashi del ataque de Kaguya.Durante la Tercera Guerra Ninja, Obito activa el Sharingan, una peculiaridad de su clan, por primera vez en la historia.[45][46] Poco antes del comienzo de la Cuarta Guerra Ninja, Obito se trasplanta el ojo Rinnegan izquierdo de Nagato, en reemplazo al ojo Sharingan izquierdo que perdió en su batalla contra Konan, por el uso del jutsu Izanagi.Durante la batalla contra Madara Uchiha en la Cuarta Gran Guerra Ninja, este finalmente recuperaría su ojo Sharingan izquierdo original y debido a las células de Hashirama Senju en su cuerpo, también pudo curar la inminente ceguera que este ojo tenía cuando estaba en posesión de Kakashi, a su vez durante la batalla final contra la diosa conejo Kaguya Ōtsutsuki, se revela que ahora con ambos ojos Sharingan puede crear portales del Kamui mucho más rápidos en comparación a cuando este usaba un solo ojo, pero también se puede notar el típico sangrado ocular que les ocurre a todos los miembros del clan Uchiha cada vez que usan técnicas que se relacionan con el Mangekyo Sharingan, también tras su muerte y pasar parte de su poder a Kakashi, despierta un Susanoo perfecto el cual posee la habilidad de lanzar unos shurikens especiales los cuales al impactar un objetivo crean un efecto Kamui que permite tele transportar partes del objetivo impactado a otras dimensiones.[48] La sexta película de la segunda parte, Road to Ninja: Naruto the Movie (2012), presenta a Obito fingiendo ser Madara.