Según el diario de Franz Hopper, Lyoko y XANA fueron creados originalmente para destruir el proyecto Cartago (Carthage project), un plan militar diseñado, en un principio, para lograr la paz mundial y evitar acciones del enemigo.
Al final, los cinco amigos decidieron, de forma algo dudosa, apagar el superordenador para siempre y empezar una nueva vida.
Como tal, cualquier persona que va a Lyoko gana un aumento en velocidad, fuerza, y agilidad; y en la práctica, uno o más superpoderes específicos, la mayoría inspirados en los de personas que los poseen individualmente (Ulrich, por ejemplo, puede moverse a supervelocidad).
Es a través de estas torres por donde XANA, o quien use el superordenador, puede atacar la Tierra.
La energía roja puede ser considerada pulsación a través de los alambres siempre que XANA active una torre.
Estos alambres se pueden separar para aislar la torre, como desconectar un cable de la red en un ordenador tradicional.
Las torres activadas por Jeremie son verdes, las activadas por Franz Hopper son blancas, las activadas por XANA son rojas, y las desactivadas azules (hasta al final de la 2.ª temporada, luego son blancas) y además cada vez que William entra o sale de una torre, él produce ondas rojas, mientras que Aelita y sus amigos producen ondas azules (aunque esto se debe a que en esos momentos William estaba bajo el control de XANA).
Las torres que hay en Lyoko pueden ser de diferentes colores: Haciendo honor a su nombre, este sector es frío, helado y con un fondo nocturno.
El agua simulada existe en este sector, y como el agua real se puede atravesar nadando (o buceando, como hace Odd) en algunos lugares, pero no pertenece al Mar digital, por lo que al tocarla los personajes no se quedan virtualizados para siempre.
Además, en el episodio 11 (La plaga), XANA podía inclinar una meseta a un ángulo de noventa grados.
Por sus picos escarpados, se parece a China y sus grandes piedras, cualquier movimiento en falso puede conducir al vacío digital.
No existe vegetación, solo pequeños árboles y grandes piedras que pueden ser muy peligrosas para nuestros héroes.
Los héroes van hasta el límite de los territorios, Jeremie introduce la clave SCIPIO y aparece una esfera de transporte en la que se meten y esta esfera los traslada hasta una plaza conocida como “arena”, en el corazón del sector 5.
Desde ahí pueden entonces acceder al núcleo, que es el acceso directo a todos los programas de Lyoko.
Nunca para de moverse, así que un salto medido cuidadosamente es necesario al subir en él.
En la cuarta temporada, nuestros héroes ya no necesitan deshabilitar el sistema de seguridad para salir.
Encima de este, los que caigan serán virtualizados para siempre como le ocurrió a Franz Hopper.
Yumi y Aelita son las únicas que han caído adentro y fueron recuperadas poco después, aunque a duras penas; Jeremie todavía no había dominado la materialización más compleja usada para hacer humana a Aelita, y pudo salvar solamente a Yumi porque fue Odd quien había introducido inadvertidamente el código apropiado anterior, creando un programa de materialización de un solo turno.
Aelita fue tirada al Mar digital por William-XANA en el episodio 82 (Recuerdos lejanos) y poco después fue rescatada por Franz Hopper.
Por dentro el Mar digital parece una especie de ciudad virtual con edificios que cuelgan del techo.
En el episodio 92 (Sudor frío), XANA reúne todas sus energías para crear un monstruo gigantesco llamado “Koloso”.
La otra Sandbox, llamada “Primera Ciudad”, es donde se esconde un arma temible y, aparte de eso, no tiene mayor utilidad.
Según los libros de Code Lyoko, que siguen una secuencia temporal alternativa, existen dos sectores más, denominados Sandboxes.
En este lugar se encuentra el arma temible que, de ser activada, podría causar un conflicto a grandes escalas.
Sin embargo, los terroristas del Green Phoenix, juntaron a un XANA casi resucitado, y activan el arma.
Para evitar el hasta ahora desconocido propósito de XANA, estos superordenadores deben ser destruidos.
Después, Jeremie teclea la clave SCIPIO (Escipión en español) y el transportador viene volando, se abre por un lateral mostrando una aurora de luz blanca, se “traga” a los Guerreros de Lyoko y los lleva hasta la “arena” del sector 5.
Es un submarino programado por Jeremie y Aelita para navegar por el Mar digital (la Red), pues al parecer los Guerreros de Lyoko no pueden sobrevivir en ese lugar, y si fuesen desvirtualizados allí se perderían para siempre.
Para luchar se desacoplan y actúan como submarinos independientes, pero no pueden volver a entrar en Lyoko por sí mismos.
Son grises oscuros, y tienen una ventana de cristales opacos desde la cual se puede tener una vista óptima del Mar digital.