[2] Posteriormente estuvo bajo el mando del general Santiago de Archiniesa para que ayudase a las islas de Barlovento y proveyese de soldados, víveres y municiones a los fuertes de Santo Domingo, Puerto Rico y La Habana.
[3][2] En 1581, se presentó ante la real audiencia de Nueva España para real su probanza de méritos, con el fin de que la corona española le concediese una plaza; sin embargo, el documento está incompleto, por lo que se desconoce sus resultados.
[2] En 1586 el rey Felipe II lo nombró alcalde mayor de las provincias de San Salvador, San Miguel y Choluteca.
[2] En el año de 1587 se avistaron en las costas del golfo de Fonseca las embarcaciones de Desire, Contente y Gerge capitaneadas por el corsario inglés Thomas Cavendish, que las autoridades españolas confundirían con Francis Drake; lo que alarmó a la población, por lo que Pinto se trasladó al Puerto de la Acajutla (de la Alcaldía mayor de Sonsonate) con su sobrino Baltazar Pinto de Amberes -junto con una tropa conformada por peninsulares, criollos, indígenas, mulatos y africanos-, sin embargo, dicho esfuerzo sería en vano ya que Cavendish nunca desembarcó.
[5] El capitán Lucas Pinto fallecería en San Salvador en el año de 1588, cuando aún seguía desempeñándose como alcalde mayor.